Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r200Q8R281 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms