Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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