Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot6Q8K3P5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms