Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms