Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Brd3Q8K2F0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms