Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c1Q8K284 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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