Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pkn3Q8K045 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkn3Q8K045 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkn3Q8K045 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms