Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms