Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms