Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Atg4dQ8BGV9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4dQ8BGV9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4dQ8BGV9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4dQ8BGV9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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