Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms