Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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