Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms