Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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