Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zbed4Q80WQ9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms