Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms