Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clec18aQ7TSQ1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clec18aQ7TSQ1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Clec18aQ7TSQ1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clec18aQ7TSQ1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Clec18aQ7TSQ1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clec18aQ7TSQ1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Clec18aQ7TSQ1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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