Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms