Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms