Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms