Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC061212Q6P8K3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms