Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tpm4Q6IRU2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms