Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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