Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ccdc18Q640L5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ccdc18Q640L5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ccdc18Q640L5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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