Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms