Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms