Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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