Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ecm2Q5FW85 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms