Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rtl5Q5DTT4 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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