Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms