Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc185Q3V118 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc185Q3V118 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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