Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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