Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms