Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms