Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp30Q3UN04 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp30Q3UN04 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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