Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms