Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms