Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms