Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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