Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms