Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms