Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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