Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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