Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Prr27Q3SYJ2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms