Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmprss11cQ1JRP2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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