Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ttc39dQ0VF76 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ttc39dQ0VF76 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ttc39dQ0VF76 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ttc39dQ0VF76 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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