Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms