Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc4Q08624 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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