Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms