Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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